Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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PTPRFP10586 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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PTPRFP10586 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 AC005831.1-201ENST00000624384 1697 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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PTPRFP10586 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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PTPRFP10586 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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PTPRFP10586 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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PTPRFP10586 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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PTPRFP10586 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRFP10586 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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