Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms