Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL355306.2-201ENST00000635570 1542 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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SH3BP1Q9Y3L3 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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SH3BP1Q9Y3L3 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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SH3BP1Q9Y3L3 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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