Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC114956.3-202ENST00000505645 482 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC023161.1-201ENST00000549532 420 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
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