Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC073488.2-201ENST00000631903 751 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC011447.6-201ENST00000623510 2598 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms