Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms