Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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GRIK2Q13002 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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GRIK2Q13002 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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GRIK2Q13002 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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GRIK2Q13002 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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