Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
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PTPREP23469 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 BTK-201ENST00000308731 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 CCDC62-203ENST00000392440 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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PTPREP23469 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 UTY-205ENST00000382896 6661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 UTY-211ENST00000540140 6652 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 UTY-214ENST00000617789 6682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 LRRC37A6P-202ENST00000448648 5444 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 TANC1-201ENST00000263635 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
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PTPREP23469 OR9M1P-202ENST00000641564 3163 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 TTC23-202ENST00000394129 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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PTPREP23469 TDGF1P3-202ENST00000602699 2710 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PTPREP23469 DDX24-211ENST00000640432 2580 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTPREP23469 DNAJC5B-201ENST00000276570 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTPREP23469 GIMAP8-201ENST00000307271 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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PTPREP23469 PLEKHG4B-204ENST00000637938 12612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
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PTPREP23469 INSL5-201ENST00000304526 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTPREP23469 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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PTPREP23469 RNPC3-208ENST00000533099 3641 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
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PTPREP23469 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTPREP23469 KIAA1217-201ENST00000307544 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MAP4-210ENST00000439356 2743 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTPREP23469 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
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PTPREP23469 XRCC6P5-201ENST00000435236 1795 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AMYH02020865.1-201ENST00000621140 2591 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 EHF-201ENST00000257831 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 PDPR-210ENST00000568530 7223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC010894.3-201ENST00000442996 2400 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ACAA2-206ENST00000589432 1840 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 HMGCR-202ENST00000343975 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ABCA17P-204ENST00000494925 3478 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MYO1B-201ENST00000304164 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MARCH6-204ENST00000503788 2874 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
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