Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AC245100.4-202ENST00000634638 1342 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CFAP73A6NFT4 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms