Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ARHGEF3Q9NR81 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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