Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 IRAK4-201ENST00000431837 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 ALG13-201ENST00000251943 3997 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC123904.1-201ENST00000441072 368 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 RHEBP1-201ENST00000448647 556 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AP001922.2-201ENST00000530435 390 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC026367.2-201ENST00000610630 553 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 Metazoa_SRP.27-201ENST00000617573 258 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 TXNRD1-219ENST00000529546 2018 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC090198.1-201ENST00000518639 2355 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 OSGIN2-201ENST00000297438 4209 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC138207.6-201ENST00000579164 1967 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 C10orf25-201ENST00000625168 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 MAPK10-281ENST00000641170 3070 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 HKR1-223ENST00000591471 3472 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 UEVLD-205ENST00000396197 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 LGI1-211ENST00000630047 1751 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 OPALIN-205ENST00000536387 3392 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 LINC02026-201ENST00000397645 1615 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AL450426.1-201ENST00000635678 1602 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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