Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC068481.1-201ENST00000415520 530 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC097717.1-225ENST00000600829 709 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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