Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC02223-203ENST00000514771 781 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 COX6CP11-201ENST00000555293 229 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 FAM27E3-202ENST00000614611 340 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL353747.4-202ENST00000625787 674 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ZFP62-207ENST00000512132 4010 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC015969.1-201ENST00000366218 1416 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL391380.1-201ENST00000439300 1432 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL357556.1-201ENST00000421884 1388 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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UBXN4Q92575 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 KLRG1-202ENST00000356986 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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UBXN4Q92575 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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UBXN4Q92575 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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UBXN4Q92575 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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UBXN4Q92575 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
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UBXN4Q92575 LINC02389-202ENST00000540024 557 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 XPNPEP3-206ENST00000614001 230 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 METAP1-212ENST00000625963 147 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC119674.1-209ENST00000642031 997 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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