Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms