Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MIR3160-2-201ENST00000637870 81 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 EBNA1BP2-201ENST00000236051 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 KRTAP9-6-201ENST00000391355 1303 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 KIT-201ENST00000288135 5186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 PDIK1L-201ENST00000374269 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC135731.2-201ENST00000603029 2098 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 TBC1D31-202ENST00000327098 2985 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 Z96074.1-203ENST00000637685 1746 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SCOC-AS1-201ENST00000512692 1987 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MYOCD-203ENST00000425538 8466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 C12orf57-201ENST00000229281 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CD44-205ENST00000352818 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 OBP2B-201ENST00000372032 702 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 TRBV6-5-201ENST00000390368 410 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 NMNAT1-202ENST00000403197 1094 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL031667.2-201ENST00000423903 323 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC245036.3-201ENST00000429259 146 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 PYHIN5P-201ENST00000431627 723 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AF274858.2-201ENST00000446370 617 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC013480.1-201ENST00000451514 346 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC092610.1-201ENST00000454916 373 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AP002852.1-201ENST00000489699 385 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC112203.1-201ENST00000506315 1020 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 DKK2-202ENST00000510463 908 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AP003354.1-201ENST00000523791 533 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 GLYATL1P3-201ENST00000527482 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC079031.2-201ENST00000537742 615 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 HNRNPA1P71-201ENST00000559135 950 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 C16orf45-203ENST00000561692 534 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SMURF2P1-202ENST00000579301 570 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RN7SL619P-201ENST00000581753 258 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 TBX18-AS1-208ENST00000591225 762 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ZNF814-212ENST00000597807 771 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms