Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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CCDC38Q502W7 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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CCDC38Q502W7 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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CCDC38Q502W7 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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CCDC38Q502W7 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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CCDC38Q502W7 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AMYH02020865.1-207ENST00000617096 458 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC38Q502W7 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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