Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC139792.1-201ENST00000607051 647 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CT45A3-202ENST00000598716 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms