Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.3 ms