Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 LMLN-AS1-201ENST00000423460 542 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 CENPN-204ENST00000428963 971 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC008040.4-201ENST00000494834 768 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC022639.1-204ENST00000520365 569 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC007785.3-202ENST00000601033 518 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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PDCD1Q15116 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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PDCD1Q15116 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PWRN1-212ENST00000569908 1435 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 ARMCX7P-201ENST00000372828 562 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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