Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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