Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms