Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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