Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGTAO43765 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGTAO43765 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.5 ms