Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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