Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL121917.1-202ENST00000424434 367 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 PRKAR1AP1-201ENST00000441422 1162 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AP003721.1-201ENST00000543907 864 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC025430.1-201ENST00000561324 498 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 DCTN5-204ENST00000563998 878 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 FRG2MP-201ENST00000613317 856 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC010320.5-201ENST00000619124 676 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 TMEM196-205ENST00000493519 687 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC103681.2-201ENST00000527450 567 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 LINC02389-202ENST00000540024 557 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 FAM192A-206ENST00000564108 1055 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC005154.6-201ENST00000598361 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms