Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AP004607.6-201ENST00000525033 1202 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
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