Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC080128.2-201ENST00000641520 11863 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 DHX32-202ENST00000368721 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 SERPINA10-201ENST00000261994 4978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 EMC1-207ENST00000477853 6664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 DIP2C-202ENST00000381496 7749 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 FKBP14-201ENST00000222803 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 DOCK8-201ENST00000382329 6124 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 BEND2-202ENST00000380033 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 OR8J1-201ENST00000303039 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 MTF1-201ENST00000373036 7972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 SLC30A8-201ENST00000427715 5430 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC112719.2-201ENST00000501239 1685 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ZNF252P-201ENST00000426361 5210 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 FXR1-202ENST00000357559 8711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms