Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 LINC01151-201ENST00000521608 571 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NRF1Q16656 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 268.2 ms