Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 MUC1-205ENST00000368389 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 MUC1-209ENST00000368396 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC024257.1-201ENST00000547523 566 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 TRIM53BP-201ENST00000532912 1720 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ETS1-204ENST00000526145 3389 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 IL31RA-206ENST00000447346 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SMIM31-201ENST00000507311 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 LINC02324-201ENST00000531609 1442 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ESRP1-204ENST00000454170 3482 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CAPNS1P1-201ENST00000401029 633 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL353754.1-201ENST00000440219 340 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SUMO2P17-201ENST00000504438 285 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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