Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 LINC01427-203ENST00000635277 781 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 CARD8-217ENST00000520753 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC025176.1-201ENST00000510261 365 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC103974.1-201ENST00000527285 874 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 LINC00964-204ENST00000528090 572 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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