Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ZNF569-205ENST00000589833 762 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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