Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC079777.1-201ENST00000623836 1953 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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CHD4Q14839 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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CHD4Q14839 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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CHD4Q14839 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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CHD4Q14839 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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CHD4Q14839 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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CHD4Q14839 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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CHD4Q14839 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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CHD4Q14839 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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CHD4Q14839 HTR2C-202ENST00000371950 4652 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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CHD4Q14839 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHD4Q14839 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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CHD4Q14839 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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CHD4Q14839 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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