Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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