Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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CUL4AQ13619 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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CUL4AQ13619 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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CUL4AQ13619 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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CUL4AQ13619 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CUL4AQ13619 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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