Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms