Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms