Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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