Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 CST13P-201ENST00000376992 428 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC009495.3-201ENST00000425688 779 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 HMGA1P4-201ENST00000428643 334 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC111198.1-201ENST00000505575 606 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AF186996.3-201ENST00000509527 964 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 LRP1-AS-201ENST00000554476 325 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MRPL45P2-203ENST00000573318 473 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL376P-201ENST00000578594 264 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC010761.2-202ENST00000582536 391 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC005262.1-201ENST00000588562 362 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP90-201ENST00000603820 236 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 uc_338.33-201ENST00000614988 170 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 Metazoa_SRP.123-201ENST00000616695 286 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 OR9K2-204ENST00000641374 1122 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL121936.1-201ENST00000641660 2884 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 LINC02334-201ENST00000617568 4959 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 SKIV2L2-201ENST00000230640 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL590999.1-201ENST00000607675 3776 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 ATXN7L1-202ENST00000419735 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MET-204ENST00000436117 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 TMEM236-201ENST00000377495 5464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 ZNF878-201ENST00000547628 1734 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 LL22NC03-63E9.3-201ENST00000407120 3111 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 KIF23-202ENST00000352331 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL133467.3-203ENST00000461160 3574 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AKAP12-203ENST00000359755 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MAPK10-343ENST00000641677 2546 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC004941.1-201ENST00000417506 3120 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AGR2-203ENST00000419304 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 SPTAN1-203ENST00000372739 7868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 OR13H1-201ENST00000338616 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RNU1-11P-201ENST00000383975 164 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 IGKV3-15-201ENST00000390252 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 PDE7A-202ENST00000396642 2986 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 PKMP3-201ENST00000405497 715 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MIR1272-201ENST00000408106 129 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 DAZAP2-202ENST00000425012 1117 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 OR10G8-201ENST00000431524 1045 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC018738.1-201ENST00000441378 210 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC107983.1-201ENST00000442562 210 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 TNR-IT1-201ENST00000455447 630 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL035660.2-201ENST00000461248 556 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 PIGA-205ENST00000482148 1092 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD55-205ENST00000513241 626 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 LINC00967-204ENST00000518412 271 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 STH-201ENST00000537309 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC079384.1-201ENST00000548506 600 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 UBE2Q2P11-201ENST00000559691 205 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC068014.1-201ENST00000576836 413 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.2 ms