Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LINC01364-201ENST00000452509 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LDHC-204ENST00000536880 957 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms