Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CAVIN4Q5BKX8 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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