Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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CCDC93Q567U6 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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CCDC93Q567U6 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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CCDC93Q567U6 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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CCDC93Q567U6 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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CCDC93Q567U6 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC93Q567U6 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
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