Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms