Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC079248.1-201ENST00000427568 1546 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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PDK4Q16654 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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PDK4Q16654 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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PDK4Q16654 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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