Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC012640.3-201ENST00000607847 430 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC239809.3-218ENST00000616018 1023 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 HYKK-205ENST00000566332 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC068389.3-201ENST00000373384 529 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 ST13P2-201ENST00000438916 1109 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 EFCAB10-204ENST00000485614 799 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 DSG1-AS1-204ENST00000581856 669 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC015802.4-202ENST00000591967 474 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms