Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC026979.2-201ENST00000523733 583 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 HNRNPCP8-201ENST00000528764 888 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ONECUT1-202ENST00000560699 996 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AP006587.6-201ENST00000582128 1091 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 HOPX-204ENST00000381260 1141 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 CLIC4P3-201ENST00000422221 752 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC078788.2-201ENST00000462300 382 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC011405.1-203ENST00000510110 1067 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC078950.1-201ENST00000538349 550 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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