Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms