Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 CABYR-206ENST00000463087 1792 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 CDY2B-201ENST00000382867 1961 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC087045.3-201ENST00000623046 2468 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 TLR3-202ENST00000504367 2310 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC126773.4-201ENST00000612545 3043 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 OR51H1-201ENST00000322059 999 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 NCALD-203ENST00000395923 3808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 RAC1P4-201ENST00000419413 579 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 RPL35P8-201ENST00000433284 337 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 RN7SL791P-201ENST00000467868 295 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 TTN-AS1-215ENST00000585451 949 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 MILR1-202ENST00000612535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 TTN-AS1-265ENST00000627661 806 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 MFSD6-201ENST00000281416 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 PSORS1C1-201ENST00000259881 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms