Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms