Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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TRAF1Q13077 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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TRAF1Q13077 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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TRAF1Q13077 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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TRAF1Q13077 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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TRAF1Q13077 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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TRAF1Q13077 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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