Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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